1.正常情况下，假如没有库存这一因素的影响，销项是大于进项的，因为一个企业的产品不可能不增值； 留抵税额多的原因，不外乎是进项多而销量小（比如季节性采购或销售），以及部分销售收入没有入账，也或者是没有采用独立交易原则使销售价格偏低（如关联企业之间的业务往来）。
2.当事人公司这种情况，是有风险的，没办法解是清楚，且税负在连续几年时高时低，急剧变化，极易引起税务机关的怀疑。